Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NOTCH4Q99466 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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