Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSPAN18Q96SJ8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSPAN18Q96SJ8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms