Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C18orf8Q96DM3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms