Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTLQ8NG68 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTLQ8NG68 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTLQ8NG68 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TTLQ8NG68 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms