Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GDPD1Q8N9F7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms