Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CENPPQ6IPU0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms