Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms