Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC12

MSS51, Putative protein MSS51 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSS51Q4VC12 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MSS51Q4VC12 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms