Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTLL9Q3SXZ7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms