Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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