Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HIST3H3Q16695 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms