Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms