Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VAMP3Q15836 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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VAMP3Q15836 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP3Q15836 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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