Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms