Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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C1orf61Q13536 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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C1orf61Q13536 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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C1orf61Q13536 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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C1orf61Q13536 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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C1orf61Q13536 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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