Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE3BQ13370 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE3BQ13370 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE3BQ13370 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE3BQ13370 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE3BQ13370 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE3BQ13370 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE3BQ13370 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE3BQ13370 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE3BQ13370 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDE3BQ13370 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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