Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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BNIP3Q12983 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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BNIP3Q12983 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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BNIP3Q12983 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP3Q12983 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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