Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXF1Q12946 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXF1Q12946 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXF1Q12946 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXF1Q12946 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXF1Q12946 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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