Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRJQ12913 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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PTPRJQ12913 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRJQ12913 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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