Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TWF1Q12792 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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