Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FAM27E3Q08E93 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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