Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLFN5Q08AF3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms