Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms