Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GOLGA3Q08378 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms