Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms