Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CD164Q04900 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
CD164Q04900 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms