Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK3Q00526 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK3Q00526 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms