Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HOXC5Q00444 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXC5Q00444 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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