Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLDN2P57739 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms