Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRIM2P49643 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRIM2P49643 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRIM2P49643 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms