Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TTPAP49638 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTPAP49638 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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