Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NMUP48645 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NMUP48645 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NMUP48645 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NMUP48645 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NMUP48645 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NMUP48645 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms