Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL3P36405 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ARL3P36405 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL3P36405 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL3P36405 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL3P36405 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL3P36405 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL3P36405 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL3P36405 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL3P36405 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL3P36405 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL3P36405 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ARL3P36405 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms