Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNB1P35222 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms