Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTX3P26022 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTX3P26022 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTX3P26022 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTX3P26022 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms