Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMNB1P20700 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMNB1P20700 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms