Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL2P13500 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCL2P13500 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCL2P13500 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCL2P13500 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCL2P13500 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCL2P13500 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCL2P13500 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCL2P13500 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL2P13500 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCL2P13500 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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