Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms