Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4FO95754 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms