Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC090772.3-201ENST00000583267 735 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNPHO15079 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 LINC02509-201ENST00000508790 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNPHO15079 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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