Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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GGTLC3B5MD39 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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GGTLC3B5MD39 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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GGTLC3B5MD39 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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GGTLC3B5MD39 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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GGTLC3B5MD39 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
GGTLC3B5MD39 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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