Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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