Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA6L4A6NEF3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms