Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms