Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEU3Q9UQ49 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms