Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCHIP1Q9P0W5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms