Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TDP1Q9NUW8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TDP1Q9NUW8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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