Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACTRT3Q9BYD9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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