Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MCMBPQ9BTE3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms