Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TIMM29Q9BSF4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms